Institutionen er en sammensmeltning af Danmarks Veterinærinstitut og Institut for Fødevaresikkerhed og Ernæring under Fødevaredirektoratet. Fødevareminister Mariann Fischer Boel har netop godkendt køreplanen for den officielle sammenlægning den 1. januar 2004.

Den nye institution får 750 medarbejdere med et budget på cirka 420 millioner kroner. Og som et udslag af regeringens politik for sektorforskningen skal den nye institution have en uafhængig bestyrelse med i alt 13 medlemmer. Derudover får den en direktion bestående af en direktør, en vicedirektør for forskning og en administrationschef plus otte afdelingsforstandere/forskningschefer.